Trong hoạt động xuất nhập khẩu hiện nay, hình thức nhập khẩu tại chỗ được nhiều doanh nghiệp lựa chọn nhằm đáp ứng nhu cầu giao nhận hàng hóa linh hoạt, tiết kiệm chi phí vận chuyển và thuận lợi trong quá trình sản xuất, gia công, kinh doanh. Tuy nhiên, do đặc thù hàng hóa không thực hiện việc vận chuyển qua cửa khẩu nhưng vẫn được xác định là hoạt động xuất nhập khẩu theo quy định pháp luật, việc xác định nghĩa vụ thuế, điều kiện hoàn thuế và thực hiện thủ tục hải quan đối với loại hình này luôn là vấn đề được nhiều doanh nghiệp đặc biệt quan tâm.

Đặc biệt, trong quá trình thực hiện thủ tục hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ, nhiều doanh nghiệp đã phát sinh vướng mắc liên quan đến việc xác định trường hợp được hoàn thuế, căn cứ pháp lý áp dụng, hồ sơ cần chuẩn bị cũng như quy trình xử lý của cơ quan hải quan. Những khó khăn này có thể ảnh hưởng trực tiếp đến quyền lợi của doanh nghiệp, làm kéo dài thời gian giải quyết hồ sơ hoàn thuế hoặc phát sinh rủi ro trong quá trình kiểm tra sau hoàn thuế.

Nhằm hướng dẫn, giải đáp các vấn đề còn vướng mắc trong thực tiễn, Cục Hải quan đã ban hành Công văn số 14596/CHQ-NVTHQ ngày 31/3/2026 về việc hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ. Công văn này đã làm rõ một số nội dung quan trọng liên quan đến chính sách hoàn thuế nhập khẩu, căn cứ áp dụng đối với các tờ khai nhập khẩu tại chỗ, điều kiện để được hoàn thuế và hồ sơ, trình tự thực hiện thủ tục hoàn thuế theo quy định hiện hành.

Theo hướng dẫn tại Công văn 14596/CHQ-NVTHQ, việc hoàn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ được xem xét trên cơ sở các quy định về hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu để sản xuất, kinh doanh nhưng đã đưa vào sản xuất hàng hóa xuất khẩu và đã xuất khẩu sản phẩm. Đồng thời, doanh nghiệp cần đối chiếu hồ sơ thực tế với các quy định về thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ theo từng giai đoạn, đặc biệt là sự thay đổi của chính sách từ ngày 01/7/2025.

Trên thực tế, việc hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ đòi hỏi doanh nghiệp phải chuẩn bị hồ sơ đầy đủ, chứng minh được quá trình nhập khẩu, sử dụng nguyên liệu, sản xuất hàng hóa xuất khẩu và đáp ứng các điều kiện theo quy định. Nếu không nắm rõ quy trình hoặc thiếu các chứng từ cần thiết, doanh nghiệp có thể gặp khó khăn trong việc chứng minh cơ sở đề nghị hoàn thuế, dẫn đến việc hồ sơ bị yêu cầu bổ sung hoặc kéo dài thời gian giải quyết.

Vậy thủ tục hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ theo Công văn 14596/CHQ-NVTHQ mới nhất được thực hiện như thế nào? Doanh nghiệp cần chuẩn bị hồ sơ gì? Điều kiện nào cần đáp ứng để được cơ quan hải quan chấp thuận hoàn thuế và những lưu ý quan trọng nào cần nắm rõ trong quá trình thực hiện? Bài viết dưới đây sẽ phân tích chi tiết các quy định mới nhất, giúp doanh nghiệp hiểu rõ quy trình hoàn thuế, chủ động chuẩn bị hồ sơ và hạn chế các rủi ro pháp lý trong hoạt động xuất nhập khẩu.

Hướng dẫn hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ theo Công văn 14596/CHQ-NVTHQ năm 2026

Ngày 2026, Cục Hải quan ban hành Công văn 14596/CHQ-NVTHQ nhằm hướng dẫn việc thực hiện hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ, trong đó làm rõ căn cứ pháp lý, chính sách thuế áp dụng cũng như trình tự, thủ tục hải quan liên quan.

Theo hướng dẫn tại Công văn này, việc xem xét hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ được thực hiện dựa trên các quy định của pháp luật về thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu, quản lý thuế và thủ tục hải quan.

Căn cứ pháp lý về hoàn thuế hàng hóa nhập khẩu tại chỗ

Việc hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ được xác định trên cơ sở các quy định sau:

• Theo khoản 2 Điều 58 Luật Ban hành văn bản quy phạm pháp luật 2025, văn bản quy phạm pháp luật được áp dụng đối với hành vi, sự kiện phát sinh trong thời gian văn bản đang có hiệu lực, trừ trường hợp văn bản có quy định áp dụng hồi tố.
• Theo khoản 3 Điều 2 Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu 2016, hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ thuộc đối tượng chịu thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu.
• Theo Điều 8 Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu 2016, thời điểm xác định thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu là thời điểm đăng ký tờ khai hải quan.
• Theo điểm d khoản 1 Điều 19 Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu 2016, một trong các trường hợp được hoàn thuế nhập khẩu là người nộp thuế đã nộp thuế đối với hàng hóa nhập khẩu để sản xuất, kinh doanh nhưng sau đó đưa vào sản xuất hàng hóa xuất khẩu và đã xuất khẩu sản phẩm.
• Quy định về phân loại hồ sơ hoàn thuế, trình tự và thủ tục hoàn thuế được thực hiện theo Chương VIII Luật Quản lý thuế 2019.
• Theo khoản 3 Điều 3 Luật số 90/2025/QH15, bổ sung quy định về kiểm tra, giám sát hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ.
• Theo khoản 2 Điều 10 và khoản 2 Điều 12 Nghị định 134/2016/NĐ-CP, được sửa đổi, bổ sung tại khoản 4 và khoản 6 Điều 1 Nghị định 18/2021/NĐ-CP, quy định chính sách thuế đối với sản phẩm gia công, sản xuất xuất khẩu thực hiện thủ tục xuất nhập khẩu tại chỗ.
• Theo Điều 36 Nghị định 134/2016/NĐ-CP, quy định về hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu để sản xuất, kinh doanh nhưng đã xuất khẩu sản phẩm.
• Theo điểm c khoản 1 Điều 35 Nghị định 08/2015/NĐ-CP và khoản 19 Điều 1 Nghị định 167/2025/NĐ-CP, quy định về thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ.
• Theo Điều 12 Thông tư 06/2021/TT-BTC, quy định về trình tự, thủ tục hoàn thuế.

Căn cứ các quy định nêu trên, Cục Hải quan hướng dẫn việc hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ như sau:

1. Quy định về chính sách thuế đối với hàng nhập khẩu tại chỗ được đề nghị hoàn thuế

Việc hoàn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa thuộc các tờ khai nhập khẩu tại chỗ được thực hiện theo quy định tại:

• Điểm h khoản 2 Điều 10 Nghị định 134/2016/NĐ-CP;
• Điểm h khoản 2 Điều 12 Nghị định 134/2016/NĐ-CP, được sửa đổi, bổ sung tại khoản 4 và khoản 6 Điều 1 Nghị định 18/2021/NĐ-CP.

Theo đó, trường hợp hàng hóa nhập khẩu tại chỗ đáp ứng đầy đủ điều kiện hoàn thuế theo quy định thì người nộp thuế được thực hiện thủ tục đề nghị hoàn số thuế nhập khẩu đã nộp.

Về hồ sơ, trình tự và thủ tục hoàn thuế, doanh nghiệp thực hiện theo:

• Điều 36 Nghị định 134/2016/NĐ-CP;
• Luật Quản lý thuế 2019;
• Điều 12 Thông tư 06/2021/TT-BTC.

2. Quy định về thủ tục hải quan đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ

Trường hợp phát sinh trước ngày 01/07/2025

Đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ phát sinh trước ngày 01/07/2025, thủ tục hải quan được thực hiện theo quy định tại Điều 35 Nghị định 08/2015/NĐ-CP.

Theo đó, hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ bao gồm trường hợp:

• Hàng hóa mua bán giữa doanh nghiệp Việt Nam với tổ chức, cá nhân nước ngoài không có hiện diện tại Việt Nam;
• Hàng hóa được thương nhân nước ngoài chỉ định giao, nhận với doanh nghiệp khác tại Việt Nam.

Đối với các tờ khai nhập khẩu tại chỗ có phát sinh đề nghị hoàn thuế nhập khẩu, doanh nghiệp phải bảo đảm đáp ứng đầy đủ điều kiện về hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ theo quy định tại Điều 35 Nghị định 08/2015/NĐ-CP.

Trường hợp phát sinh từ ngày 01/07/2025 đến nay

Từ ngày 01/07/2025, việc thực hiện thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ được áp dụng theo:

• Luật số 90/2025/QH15;
• Điều 35 Nghị định 08/2015/NĐ-CP được sửa đổi, bổ sung tại khoản 19 Điều 1 Nghị định 167/2025/NĐ-CP.

Theo quy định mới, hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ được hiểu là hàng hóa được giao nhận tại Việt Nam theo chỉ định của thương nhân nước ngoài trên cơ sở các giao dịch như:

• Hợp đồng mua bán;
• Hợp đồng gia công;
• Hợp đồng thuê;
• Hợp đồng mượn;

Giữa các doanh nghiệp Việt Nam với thương nhân nước ngoài.

Thủ tục hải quan, kiểm tra và giám sát hải quan đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ theo Nghị định 167/2025/NĐ-CP

Theo quy định tại Điều 35 Nghị định 08/2015/NĐ-CP được sửa đổi, bổ sung bởi khoản 19 Điều 1 Nghị định 167/2025/NĐ-CP, thủ tục hải quan, việc kiểm tra và giám sát hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ được thực hiện theo các nguyên tắc cụ thể nhằm bảo đảm quản lý chặt chẽ hoạt động giao nhận hàng hóa nhưng vẫn tạo thuận lợi cho doanh nghiệp.

1. Các trường hợp được xác định là hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ

Căn cứ khoản 1 Điều 47a Luật Hải quan 2014 được bổ sung tại khoản 3 Điều 3 Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Đấu thầu; Luật Đầu tư theo phương thức đối tác công tư; Luật Hải quan; Luật Thuế giá trị gia tăng; Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu; Luật Đầu tư; Luật Đầu tư công; Luật Quản lý, sử dụng tài sản công năm 2025, hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ bao gồm:

Trường hợp 1: Hàng hóa gia công tại Việt Nam

Là hàng hóa được sản xuất, gia công tại Việt Nam theo hợp đồng với thương nhân nước ngoài và được thương nhân nước ngoài bán hoặc chuyển giao cho tổ chức, cá nhân khác tại Việt Nam.

Trường hợp 2: Hàng hóa mua bán, thuê, mượn giữa doanh nghiệp Việt Nam và thương nhân nước ngoài

Bao gồm hàng hóa phát sinh từ giao dịch:

• Mua bán;
• Thuê;
• Mượn;

giữa doanh nghiệp Việt Nam với thương nhân nước ngoài, trong đó thương nhân nước ngoài chỉ định doanh nghiệp tại Việt Nam khác thực hiện việc giao, nhận hàng hóa.

2. Quy định về thủ tục hải quan, kiểm tra và giám sát đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ

Đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ, doanh nghiệp phải thực hiện thủ tục hải quan theo quy định và chịu sự kiểm tra, giám sát của cơ quan hải quan trong toàn bộ quá trình liên quan.

Cụ thể:

• Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ bắt buộc phải thực hiện thủ tục hải quan;
• Doanh nghiệp có thể lựa chọn phương thức:
  • Giao, nhận hàng hóa trước rồi thực hiện thủ tục hải quan sau;
  • Hoặc hoàn thành thủ tục hải quan trước rồi tiến hành giao, nhận hàng hóa sau.
• Hàng hóa chịu sự kiểm tra, giám sát của cơ quan hải quan:
  • Từ thời điểm giao, nhận hàng hóa cho đến khi hoàn tất thủ tục hải quan; hoặc
  • Từ thời điểm hoàn thành thủ tục hải quan cho đến khi hoàn tất việc giao, nhận hàng hóa.

3. Khi nào hàng hóa nhập khẩu tại chỗ được xác định hoàn thành thủ tục hải quan?

Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ chỉ được xem là hoàn thành thủ tục hải quan khi:

• Tờ khai xuất khẩu tại chỗ đã hoàn thành thủ tục hải quan;
• Tờ khai nhập khẩu tại chỗ cũng đã hoàn thành thủ tục hải quan.

Việc hoàn tất đồng thời cả hai tờ khai là căn cứ xác định giao dịch xuất nhập khẩu tại chỗ đã được xử lý đầy đủ theo quy định.

4. Quy định về thời gian, địa điểm và phương thức giao nhận hàng hóa

Thời hạn, địa điểm cũng như phương thức giao nhận hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ được thực hiện theo chỉ định của thương nhân nước ngoài.

Các thông tin này phải được doanh nghiệp:

• Thông báo cho cơ quan hải quan khi thực hiện thủ tục hải quan; hoặc
• Thông báo trước thời điểm thực hiện giao, nhận hàng hóa.

Trách nhiệm thu thập và cung cấp thông tin hải quan của cơ quan hải quan

Bên cạnh quy định về quản lý hàng hóa xuất nhập khẩu tại chỗ, Điều 106 Nghị định 08/2015/NĐ-CP được sửa đổi, bổ sung bởi khoản 59 Điều 1 Nghị định 167/2025/NĐ-CP cũng quy định cụ thể trách nhiệm của cơ quan hải quan trong việc thu thập và cung cấp thông tin phục vụ công tác quản lý nhà nước về hải quan.

Trách nhiệm thu thập thông tin hải quan

Cơ quan hải quan có trách nhiệm tổ chức thu thập thông tin thông qua các hoạt động sau:

Tiếp nhận và xử lý thông tin hải quan

Cơ quan hải quan thực hiện tiếp nhận, phân tích và xử lý thông tin thông qua việc:

• Cung cấp, trao đổi thông tin;
• Kết nối, chia sẻ dữ liệu;
• Phối hợp với các cơ quan quản lý nhà nước, tổ chức và cá nhân có liên quan đến lĩnh vực hải quan.

Cử công chức hải quan thực hiện thu thập thông tin ở nước ngoài

Cơ quan hải quan có thể cử công chức ra nước ngoài để thực hiện hoạt động thu thập thông tin phục vụ quản lý nhà nước về hải quan theo quy định tại khoản 1 Điều 6 và Điều 96 Luật Hải quan 2014.

Việc hướng dẫn cụ thể về hoạt động thu thập thông tin nghiệp vụ hải quan được thực hiện theo quy định của Bộ trưởng Bộ Tài chính.

Thực hiện các biện pháp nghiệp vụ khác

Ngoài các phương thức trên, cơ quan hải quan được áp dụng các biện pháp nghiệp vụ cần thiết nhằm thu thập thông tin liên quan đến:

• Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu;
• Phương tiện vận tải;
• Tổ chức, cá nhân tham gia hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu, xuất cảnh, nhập cảnh, quá cảnh.

Trách nhiệm cung cấp thông tin hải quan

Cơ quan hải quan có trách nhiệm cung cấp thông tin cho các chủ thể có liên quan, bao gồm:

Cung cấp thông tin về chính sách và thủ tục hải quan

Cơ quan hải quan cung cấp thông tin về:

• Chế độ, chính sách hải quan;
• Quy định, hướng dẫn thực hiện thủ tục hải quan;

cho các tổ chức, cá nhân tham gia hoặc có liên quan đến hoạt động sản xuất, xuất khẩu, nhập khẩu, xuất cảnh, nhập cảnh và quá cảnh.

Cung cấp thông tin về quyền và nghĩa vụ của người khai hải quan

Người khai hải quan được cung cấp các thông tin cần thiết liên quan đến:

• Quyền lợi được hưởng;
• Nghĩa vụ phải thực hiện;
• Trách nhiệm trong quá trình làm thủ tục hải quan.

Cung cấp thông tin cho cơ quan nhà nước có thẩm quyền

Cơ quan hải quan thực hiện cung cấp thông tin hải quan cho:

• Cơ quan tư pháp;
• Cơ quan quản lý nhà nước khác;
• Cơ quan hải quan nước ngoài;
• Tổ chức quốc tế.

Việc cung cấp được thực hiện phù hợp với:

• Quy định pháp luật Việt Nam;
• Điều ước quốc tế mà Việt Nam là thành viên;
• Các thỏa thuận quốc tế đã được ký kết.

Cung cấp thông tin thống kê và hồ sơ hải quan

Ngoài ra, cơ quan hải quan còn có trách nhiệm:

• Cung cấp thông tin thống kê hải quan theo quy định của pháp luật về thống kê;
• Cung cấp thông tin hồ sơ hải quan cho người khai hải quan trong trường hợp xảy ra sự kiện bất khả kháng cần khôi phục dữ liệu hồ sơ.

Kết luận

Có thể thấy, hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ là một thủ tục có ý nghĩa quan trọng đối với doanh nghiệp, đặc biệt là các doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực gia công, sản xuất xuất khẩu hoặc có phát sinh giao dịch nhập khẩu nguyên liệu, vật tư phục vụ hoạt động sản xuất. Việc được hoàn lại khoản thuế nhập khẩu đã nộp trong trường hợp đáp ứng đủ điều kiện không chỉ giúp doanh nghiệp giảm chi phí đầu vào mà còn góp phần nâng cao hiệu quả sản xuất, kinh doanh và khả năng cạnh tranh trên thị trường.

Thông qua Công văn 14596/CHQ-NVTHQ năm 2026, Cục Hải quan đã hướng dẫn cụ thể hơn về việc xử lý các vướng mắc liên quan đến hoàn thuế đối với các tờ khai nhập khẩu tại chỗ, trong đó nhấn mạnh việc doanh nghiệp cần căn cứ vào quy định pháp luật về thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu, pháp luật quản lý thuế và quy định về thủ tục hải quan để xác định quyền được hoàn thuế. Đồng thời, hồ sơ đề nghị hoàn thuế cần được rà soát kỹ lưỡng, bảo đảm đầy đủ căn cứ chứng minh hàng hóa nhập khẩu đã được sử dụng đúng mục đích và đáp ứng điều kiện hoàn thuế theo quy định.

Để quá trình hoàn thuế diễn ra thuận lợi, doanh nghiệp cần chủ động xây dựng quy trình kiểm soát chứng từ ngay từ thời điểm phát sinh hoạt động nhập khẩu tại chỗ. Các tài liệu như tờ khai hải quan, hợp đồng, chứng từ thanh toán, hồ sơ sản xuất, chứng từ xuất khẩu sản phẩm và các tài liệu liên quan cần được lưu giữ đầy đủ, thống nhất nhằm phục vụ việc chứng minh với cơ quan hải quan khi thực hiện thủ tục hoàn thuế hoặc khi có yêu cầu kiểm tra sau hoàn thuế.

Bên cạnh đó, doanh nghiệp cũng cần thường xuyên cập nhật các quy định mới về chính sách thuế và thủ tục hải quan, đặc biệt là những thay đổi liên quan đến hoạt động xuất nhập khẩu tại chỗ. Việc hiểu đúng quy định, áp dụng đúng căn cứ pháp lý và chuẩn bị hồ sơ đầy đủ không chỉ giúp doanh nghiệp bảo đảm quyền lợi về thuế mà còn hạn chế nguy cơ bị từ chối hoàn thuế, truy thu hoặc xử lý vi phạm trong quá trình quản lý thuế.

Trong bối cảnh hoạt động thương mại quốc tế ngày càng phát triển và yêu cầu quản lý hải quan ngày càng chặt chẽ, việc nắm vững thủ tục hoàn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu tại chỗ theo Công văn 14596 mới nhất là yếu tố quan trọng giúp doanh nghiệp chủ động trong hoạt động sản xuất, kinh doanh. Thực hiện đúng ngay từ khâu chuẩn bị hồ sơ sẽ giúp doanh nghiệp tiết kiệm thời gian, giảm chi phí tuân thủ và tối ưu hiệu quả quản trị thuế trong dài hạn.

Tư vấn Thuế HD là đơn vị uy tín hoạt động chuyên sâu trong lĩnh vực tư vấn thuế, kế toán và hỗ trợ pháp lý cho doanh nghiệp. Với mục tiêu mang đến giải pháp toàn diện cho khách hàng, công ty cung cấp đầy đủ các dịch vụ liên quan đến thuế như kê khai và báo cáo thuế, quyết toán thuế, hoàn thuế, tư vấn chính sách thuế, xử lý hồ sơ kế toán, thành lập doanh nghiệp và hỗ trợ giải trình với cơ quan thuế. Sở hữu đội ngũ chuyên viên giàu kinh nghiệm, tận tâm và luôn cập nhật nhanh chóng những thay đổi mới nhất của pháp luật, Tư vấn Thuế HD giúp doanh nghiệp tối ưu chi phí vận hành, hạn chế rủi ro về thuế và đảm bảo tuân thủ đúng quy định hiện hành. Bằng sự chuyên nghiệp, minh bạch và đồng hành lâu dài cùng khách hàng, công ty đã trở thành đối tác tin cậy của nhiều cá nhân, hộ kinh doanh và doanh nghiệp trên toàn quốc.

Thông tin:

• Website: tuvanthuehd.com
• Địa chỉ: Lô a2d11 Khu đô thị mới Cầu Giấy, số 3 ngõ 84 đường Trần Thái Tông, Phường Cầu Giấy, Thành Phố Hà Nội, Việt Nam.
• SĐT: 036.825.6731 – 034. 943.2286
• Email: [email protected]